Pada tahun 2000, Habib Hasan mendirikan Majelis Nurul Musthofa, sebuah lembaga yang bertujuan untuk mendekatkan diri kepada Allah dan Rasulullah SAW.
Selama hidupnya, beliau aktif dalam kegiatan dakwah dan pendidikan agama.
Habib Hasan bin Ja’far Assegaf meninggalkan istrinya, Syarifah Muznah binti Ahmada Al-Haddad, dan tujuh orang anak, yaitu Ruqayah Hasan Assegaf, Atthos Abdullah Hasan Assegaf, Ali Uraidy Hasan Assegaf, Abdul Qadir Hasan Assegaf, Segaf Hasan Assegaf, Ja’far Hasyimi Hasan Assegaf, serta Ahmad Anis Hasyimi Hasan Assegaf.
Kehilangan sosok ulama dan pemimpin agama yang karismatik ini menjadi duka yang mendalam bagi masyarakat muslim Indonesia.
Semoga Habib Hasan bin Ja’far Assegaf diberikan tempat yang mulia di sisi Allah SWT. Amin. ***
