Meskipun menjadi PPPK membawa banyak manfaat, namun ada juga tantangan dan masalah yang perlu diatasi dalam implementasinya. Beberapa di antaranya adalah:
- Proses pengangkatan dan persyaratan: Pemerintah perlu memastikan bahwa proses pengangkatan perangkat desa menjadi PPPK dilakukan secara transparan dan adil serta memberikan peluang yang sama bagi seluruh perangkat desa yang memenuhi syarat. Pemerintah juga perlu menetapkan persyaratan yang sesuai dengan kriteria dan kebutuhan perangkat desa, seperti pendidikan, pengalaman, dan kompetensi.
- Dukungan dan pelatihan: Pemerintah perlu memberikan dukungan yang memadai bagi perangkat desa yang menjadi PPPK, baik dalam hal fasilitas, anggaran, maupun pengawasan. Pemerintah juga perlu menyelenggarakan pelatihan yang berkualitas dan berkelanjutan bagi perangkat desa, baik sebelum maupun sesudah menjadi PPPK, untuk meningkatkan kemampuan dan keterampilan mereka.
- Sinergi dan kolaborasi: Pemerintah perlu menciptakan sinergi dan kolaborasi yang baik antara perangkat desa dengan Kepala Desa, masyarakat, dan pemangku kepentingan lainnya. Pemerintah juga perlu menghormati dan mengakui otonomi dan kemandirian desa dalam mengelola pemerintahan, pelayanan, dan pembangunan desa.
